Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3AQ92484 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms