Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTTNBP2Q8WZ74 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms