Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms