Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CSNK2A3Q8NEV1 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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