Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms