Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms