Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG9AQ7Z3C6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG9AQ7Z3C6 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG9AQ7Z3C6 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG9AQ7Z3C6 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG9AQ7Z3C6 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG9AQ7Z3C6 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG9AQ7Z3C6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG9AQ7Z3C6 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG9AQ7Z3C6 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG9AQ7Z3C6 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG9AQ7Z3C6 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG9AQ7Z3C6 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG9AQ7Z3C6 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG9AQ7Z3C6 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG9AQ7Z3C6 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG9AQ7Z3C6 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG9AQ7Z3C6 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG9AQ7Z3C6 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG9AQ7Z3C6 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG9AQ7Z3C6 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG9AQ7Z3C6 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG9AQ7Z3C6 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG9AQ7Z3C6 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG9AQ7Z3C6 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG9AQ7Z3C6 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG9AQ7Z3C6 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms