Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HACD2Q6Y1H2 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms