Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms