Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms