Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms