Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms