Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LACTB2Q53H82 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms