Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms