Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RNF212Q495C1 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms