Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBPF1Q3BBV0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF1Q3BBV0 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms