Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
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