Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCOA1Q15788 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
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