Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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