Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms