Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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TRIP10Q15642 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP10Q15642 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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TRIP10Q15642 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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TRIP10Q15642 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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TRIP10Q15642 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms