Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AC015912.3-201ENST00000619432 348 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 AC022966.2-201ENST00000587434 367 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
RYR3Q15413 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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