Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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