Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCAPHQ15003 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCAPHQ15003 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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