Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFIXQ14938 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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