Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHD4Q14839 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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CHD4Q14839 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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CHD4Q14839 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
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CHD4Q14839 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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CHD4Q14839 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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