Protein–RNA interactions for Protein: Q14409

GK3P, Glycerol kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GK3PQ14409 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GK3PQ14409 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GK3PQ14409 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GK3PQ14409 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GK3PQ14409 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GK3PQ14409 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GK3PQ14409 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GK3PQ14409 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GK3PQ14409 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GK3PQ14409 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GK3PQ14409 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GK3PQ14409 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GK3PQ14409 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GK3PQ14409 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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GK3PQ14409 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GK3PQ14409 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GK3PQ14409 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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GK3PQ14409 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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GK3PQ14409 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GK3PQ14409 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GK3PQ14409 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GK3PQ14409 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GK3PQ14409 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GK3PQ14409 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GK3PQ14409 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GK3PQ14409 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GK3PQ14409 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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GK3PQ14409 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GK3PQ14409 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GK3PQ14409 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GK3PQ14409 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GK3PQ14409 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GK3PQ14409 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GK3PQ14409 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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GK3PQ14409 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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GK3PQ14409 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GK3PQ14409 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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GK3PQ14409 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GK3PQ14409 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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GK3PQ14409 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GK3PQ14409 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GK3PQ14409 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GK3PQ14409 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GK3PQ14409 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GK3PQ14409 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GK3PQ14409 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GK3PQ14409 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GK3PQ14409 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GK3PQ14409 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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GK3PQ14409 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GK3PQ14409 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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