Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
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