Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAPSQ13938 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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