Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTR4Q13639 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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