Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDAC1Q13547 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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