Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CBX3Q13185 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CBX3Q13185 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CBX3Q13185 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CBX3Q13185 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CBX3Q13185 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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