Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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