Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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