Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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