Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
AP1B1Q10567 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms