Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EP300Q09472 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EP300Q09472 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EP300Q09472 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EP300Q09472 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EP300Q09472 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EP300Q09472 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EP300Q09472 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EP300Q09472 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EP300Q09472 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EP300Q09472 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EP300Q09472 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EP300Q09472 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EP300Q09472 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EP300Q09472 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EP300Q09472 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EP300Q09472 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EP300Q09472 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EP300Q09472 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EP300Q09472 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EP300Q09472 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EP300Q09472 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EP300Q09472 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EP300Q09472 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EP300Q09472 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EP300Q09472 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EP300Q09472 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EP300Q09472 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EP300Q09472 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EP300Q09472 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EP300Q09472 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EP300Q09472 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EP300Q09472 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EP300Q09472 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EP300Q09472 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EP300Q09472 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EP300Q09472 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EP300Q09472 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EP300Q09472 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EP300Q09472 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EP300Q09472 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EP300Q09472 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EP300Q09472 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EP300Q09472 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EP300Q09472 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EP300Q09472 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EP300Q09472 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EP300Q09472 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EP300Q09472 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EP300Q09472 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EP300Q09472 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EP300Q09472 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EP300Q09472 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EP300Q09472 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EP300Q09472 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EP300Q09472 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EP300Q09472 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EP300Q09472 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EP300Q09472 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EP300Q09472 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EP300Q09472 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EP300Q09472 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EP300Q09472 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EP300Q09472 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EP300Q09472 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EP300Q09472 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EP300Q09472 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EP300Q09472 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EP300Q09472 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EP300Q09472 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EP300Q09472 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EP300Q09472 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EP300Q09472 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EP300Q09472 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EP300Q09472 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EP300Q09472 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EP300Q09472 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EP300Q09472 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EP300Q09472 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EP300Q09472 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EP300Q09472 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EP300Q09472 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EP300Q09472 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EP300Q09472 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EP300Q09472 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EP300Q09472 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EP300Q09472 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EP300Q09472 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EP300Q09472 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EP300Q09472 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EP300Q09472 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EP300Q09472 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EP300Q09472 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EP300Q09472 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EP300Q09472 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EP300Q09472 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EP300Q09472 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EP300Q09472 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EP300Q09472 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EP300Q09472 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms