Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE4DQ08499 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms