Protein–RNA interactions for Protein: Q08380

LGALS3BP, Galectin-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS3BPQ08380 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LGALS3BPQ08380 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms