Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TGM3Q08188 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms