Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIN1Q05586 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms