Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
CD164Q04900 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
CD164Q04900 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms