Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GBE1Q04446 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GBE1Q04446 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms