Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREMQ03060 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREMQ03060 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREMQ03060 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREMQ03060 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREMQ03060 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREMQ03060 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREMQ03060 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREMQ03060 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREMQ03060 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREMQ03060 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREMQ03060 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREMQ03060 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREMQ03060 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREMQ03060 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREMQ03060 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREMQ03060 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREMQ03060 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREMQ03060 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREMQ03060 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREMQ03060 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREMQ03060 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CREMQ03060 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREMQ03060 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREMQ03060 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREMQ03060 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREMQ03060 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREMQ03060 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREMQ03060 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CREMQ03060 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREMQ03060 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREMQ03060 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREMQ03060 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CREMQ03060 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CREMQ03060 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CREMQ03060 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CREMQ03060 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CREMQ03060 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CREMQ03060 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CREMQ03060 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CREMQ03060 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CREMQ03060 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CREMQ03060 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CREMQ03060 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CREMQ03060 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CREMQ03060 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CREMQ03060 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CREMQ03060 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CREMQ03060 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CREMQ03060 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CREMQ03060 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CREMQ03060 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CREMQ03060 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CREMQ03060 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CREMQ03060 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CREMQ03060 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CREMQ03060 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CREMQ03060 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CREMQ03060 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CREMQ03060 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CREMQ03060 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CREMQ03060 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CREMQ03060 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CREMQ03060 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CREMQ03060 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CREMQ03060 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CREMQ03060 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CREMQ03060 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CREMQ03060 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CREMQ03060 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CREMQ03060 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CREMQ03060 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CREMQ03060 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CREMQ03060 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CREMQ03060 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CREMQ03060 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CREMQ03060 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CREMQ03060 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CREMQ03060 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CREMQ03060 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CREMQ03060 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CREMQ03060 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CREMQ03060 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CREMQ03060 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CREMQ03060 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CREMQ03060 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CREMQ03060 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CREMQ03060 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CREMQ03060 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CREMQ03060 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CREMQ03060 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CREMQ03060 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CREMQ03060 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CREMQ03060 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CREMQ03060 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CREMQ03060 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CREMQ03060 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CREMQ03060 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CREMQ03060 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CREMQ03060 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms