Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IRF8Q02556 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms