Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDR2Q01850 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms