Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPCQ01831 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPCQ01831 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPCQ01831 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPCQ01831 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPCQ01831 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPCQ01831 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPCQ01831 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPCQ01831 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPCQ01831 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPCQ01831 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
XPCQ01831 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPCQ01831 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPCQ01831 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPCQ01831 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPCQ01831 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPCQ01831 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPCQ01831 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPCQ01831 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPCQ01831 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPCQ01831 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPCQ01831 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XPCQ01831 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XPCQ01831 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XPCQ01831 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XPCQ01831 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XPCQ01831 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XPCQ01831 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XPCQ01831 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XPCQ01831 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XPCQ01831 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XPCQ01831 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XPCQ01831 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XPCQ01831 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XPCQ01831 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XPCQ01831 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XPCQ01831 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XPCQ01831 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XPCQ01831 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XPCQ01831 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XPCQ01831 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
XPCQ01831 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XPCQ01831 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
XPCQ01831 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
XPCQ01831 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
XPCQ01831 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
XPCQ01831 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
XPCQ01831 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
XPCQ01831 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
XPCQ01831 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPCQ01831 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPCQ01831 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPCQ01831 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPCQ01831 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPCQ01831 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
XPCQ01831 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPCQ01831 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPCQ01831 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPCQ01831 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPCQ01831 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPCQ01831 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPCQ01831 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPCQ01831 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPCQ01831 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPCQ01831 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPCQ01831 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPCQ01831 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPCQ01831 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPCQ01831 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
XPCQ01831 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPCQ01831 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPCQ01831 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPCQ01831 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPCQ01831 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPCQ01831 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPCQ01831 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPCQ01831 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPCQ01831 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPCQ01831 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPCQ01831 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPCQ01831 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPCQ01831 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPCQ01831 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPCQ01831 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPCQ01831 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
XPCQ01831 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPCQ01831 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPCQ01831 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPCQ01831 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPCQ01831 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPCQ01831 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
XPCQ01831 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPCQ01831 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPCQ01831 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPCQ01831 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPCQ01831 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
XPCQ01831 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPCQ01831 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPCQ01831 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XPCQ01831 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms