Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms