Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SCN7AQ01118 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms