Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-24P63145 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms